仰视千七百二十九鹤斋丛书 赵之谦编 民国23年（1934）国图藏
清人考订笔记七种 中华书局 1965 线装据嘉庆邵氏面水层轩刻本影印 2004年再版精装国图藏
清人考订笔记九种 台北：文海出版社 1983 国图藏
丛书集成续编 上海书店出版社1994国图藏
《南江集钞》四卷
未详，疑为《南江诗文钞》。
王绍曾等《清史稿艺文志拾遗》录有：
《周易邵注》无卷数 邵晋涵 集
原稿本，题为面水层轩。见《贩书偶记续编》。
未详，另有《邵氏易传》邵晋涵 注 国图藏抄本
《诗经纂》一卷
稿本，浙江宁波天一阁藏，见《中国善本书书目稿本》经部。
《韩诗内传考》不分卷
清沈氏鸣野山房抄本 见《中国善本书书目》。 浙图藏
《二十三史提要底本》一卷
嘉庆六年朱锡庚抄本 见台湾中央研究院历史语言研究所善本书目（1986年台北排印本）
《南江文钞》十二卷 《南江诗钞》四卷
南江邵氏遗书 清道光元年（1821）刻本 国图藏
仁和胡敬 道光十二年（1832）胡敬刻本 国图藏 另见《中国善本书书目》、《贩书偶记》。
南江邵氏遗书 清嘉庆九年（1804）刻本 《南江文钞》四卷 国图藏
另查有：
《南江书录》一卷
聚学轩丛书 刘世珩辑 清乾隆四十年（1875）刻本 国图藏
江苏广陵古籍刻印社1982 影印本 国图藏
《余姚志》乾隆 四十卷 清 唐若瀛 修 清 邵晋涵 纂
清乾隆四十六年（1781）刻本 国图藏
据黄云眉《邵二云年谱》，修于乾隆四十三年（1778）。
《杭州府志》乾隆 一百十卷 清 郑沄 修 清 邵晋涵 纂
清乾隆四十九年（1784）刻本 国图藏
据黄云眉《邵二云年谱》，修于乾隆四十二年（1777）；续修于乾隆四十九年（1784）。
辑校诸书：
《旧五代史》 一百五十卷目录二卷 宋 薛居正等 撰 清 邵晋涵等 辑
清卢氏袌经楼抄本 国图藏
据黄云眉《邵二云年谱》，此书成于乾隆四十年（1775）。
《新唐书纠谬》二十卷 宋 吴缜 撰 清 周嘉猷 校跋录 清 邵晋涵 校
南京图书馆藏
据黄云眉《邵二云年谱》，校此书在乾隆三十一年（1766）。
《西汉年纪》 三十卷 宋 王益之 撰 清 邵晋涵 校
四库底本 国图藏
《五代春秋》二卷 宋 尹洙 撰 清 邵晋涵 校跋 清 赵怀玉 校跋 清 丁丙 跋
南京图书馆藏
《史记辑评》十卷 汉 司马迁 撰 清 邵晋涵 辑评
上海：会文堂书局 民国八年（1919） 国图藏
据黄云眉《邵二云年谱》，尚有《续通志·金石略》，编于乾隆三十九年（1774）。审正毕沅《续资治通鉴》，于乾隆五十七年（1792）修成。
则传记资料中称列《孟子述义》、《谷梁正义》、《輶轩日记》、《方舆金石编目》、《宋元事鉴考异》今并不传。
三、《南江诗文抄、札记》篇卷述略
《南江札记》四卷：春秋左氏传一卷，仪礼正误、礼记三礼合一卷，孟子一卷，史记、汉书、后汉书、三国志、五代史、宋史合一卷。
《南江诗抄》四卷
《南江文钞》：
嘉庆九年（1804）刻本四卷，据黄云眉《邵二云年谱》，卷一卷二：赋八篇，应制文二十篇；卷三：四库提要三十七篇；卷四：祠庙碑记七篇，序二十九篇。
据《续修四库全书》影印道光十二年（1832）胡敬刻本，十二卷：
卷一至四：应制文；卷五卷六：赋八篇，拟疏一篇，祠庙碑记七篇，序二十九篇；卷七：序十七篇；卷八：书九篇，策问一篇，考一篇，跋二篇，书后七篇，题词一篇，铭一篇，赞一篇；卷九：传十一篇；卷十：祭文二十篇，行状四篇；卷十一：墓志铭二十篇；卷十二：四库提要三十七篇。
道光十二卷本包括嘉庆四卷本全部内容，而有增广。
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